CCER項目開發(fā)流程主要包括6個步驟,依次是項目文件設計、項目審定、項目備案、項目實施與監(jiān)測、減排量核查與核證、減排量備案與簽發(fā);CDM的項目開發(fā)則有項目文件設計、東道國政府審查并批準、項目審定、項目注冊、項目實施與監(jiān)測、減排量核證、減排量簽發(fā)等7個流程。兩者最主要的區(qū)別是CDM由清潔發(fā)展機制執(zhí)行理事會(CDM-EB)管理和簽發(fā),而CCER由我國生態(tài)環(huán)境部(原國家發(fā)展和改革委)應對氣候變化司管理和簽發(fā)。此外,CDM雙邊項目涉及減排國家認定,在項目審定的同時或前后需要獲得各國主管部門(DNA)的批準函(Letter of Approval)。